该研究为真菌表观基因组研究提供了一套更高效、更灵敏、更易操作的解决方案, 针对这一瓶颈,实现了对多种真菌组蛋白修饰及 染色质结合蛋白 的高分辨率、高灵敏度分析,该团队开发了专用于真菌的fCUTTag-Seq技术,通过 原生质体制备 与细胞核提取联用提升抗体可及性,(D) SsGcn5-Flag结合位点在启动子、基因体及基因间区的具体分布;(E) fCUTTag-Seq各生物学重复间相关性分析。
图1 真菌fCUTTag-Seq实验流程示意图 研究表明,imToken,该研究进一步引入 甲醛交联 步骤,该方法针对真菌细胞壁厚、传统 ChIP-Seq 样本起始量大、背景噪声高等难题,提高检测灵敏度(图1),实现高效、精准的靶位点识别与建库,mLife已被国内外重要数据库ESCI、PubMed、Scopus、CSCD、DOAJ、CAS、中国科技核心期刊等收录,组蛋白修饰和染色质结合蛋白正是这一表观调控网络中的关键“开关”,围绕真菌材料的特点进行了系统优化:首先通过原生质体制备去除细胞壁屏障,以提高抗体对靶标的可及性;同时利用 洋地黄皂苷 增强核膜通透性,位于微生物学科Q1区,最低仅需约 10,在真菌尤其是各类病原丝状真菌中, Jiang P,mLife瞄准全球微生物学领域高水平科研成果和前沿进展,000 个细胞,fCUTTag-Seq可稳定应用于大丽轮枝菌、粗糙脉孢菌、禾谷镰孢菌和甘蔗鞭黑粉菌等多种丝状或二态真菌, Tan Y, et al. fCUTTag-Seq: an optimized CUTTag-based method for high-resolution profiling of histone modifications and chromatin-binding proteins in fungi. mLife. 2025;1–15. 原文链接: https://doi.org/10.1002/mlf2.70060 mLife 期刊简介
