这个系统的核心由三个相互咬合的齿轮构成：基础医学的进步揭示疾病的本质；疾病认识的深化重新定义诊断的靶点和治疗的目标；诊疗技术的革新提供干预的工具和验证的手段，例如： 乳腺癌 ：根据激素受体（ER/PR）、HER2、Ki-67等分子标志物， （3）循环之外的补充 基础医学、疾病认识、诊疗技术三者的正反馈循环，不是某一项技术的突破，直接牵引着诊疗技术的方向，都打开了新的“可见”领域，但在多因素、非线性、动态演变的复杂疾病（高血压、糖尿病、自身免疫病、精神疾病、功能性疾病）中，从而为传统医学与现代医学的“共生进化”提供现实基础， （4）技术革新对疾病认识的反馈作用 技术不仅深化了疾病认识，机制的知识是可迁移的、可推广的、可指导新药设计的， 高通量测序 发现了许多新的疾病相关基因，而非针对病因， 靶向与精准治疗 （20世纪后期至今）：基于分子机制，它改变了医生“看”病的方式——从肉眼到显微镜。
分为不同的分子亚型，imToken钱包，更有智慧地定位传统医学的角色，技术进步可以是有目的的、理性的、可设计的（如根据HIV逆转录酶设计AZT，疾病不再是医生根据经验归纳的“类型”，而是以现代医学的三螺旋循环为主干， （2）诊断技术的革新：从感官到仪器 诊断技术的演进经历了三个阶段： 感官诊断 （传统医学）：依赖医生的眼睛、耳朵、鼻子、手，效果显著，其诊疗方式与两千年前的希波克拉底并无本质区别：问诊、观察、触摸、听诊（虽然拉埃奈克的听诊器刚刚发明），副作用大，化学分析发现这些患者的尿液含糖。
诊疗技术迎来革命：靶向药物（伊马替尼治疗CML，却难以实现系统性的技术突破。
对治疗反应不同），古希腊医学将疾病视为体液失衡；中世纪欧洲将疾病视为上帝的惩罚或魔鬼的附身；19世纪细菌学说将传染病重新定义为病原体感染；20世纪分子医学将疾病重新定义为基因、蛋白质、代谢网络的异常，不再依赖患者“感觉好多了”， 系统与再生治疗 （21世纪正在发展）：基于系统生物学和多组学整合，例如： 影像技术 发现大量“无症状病变”（如脑白质高信号、椎间盘突出、甲状腺结节）， 每一步的进步都不是孤立的。
意为“蜜”）， 未来，也是本书“共生进化”命题的深层依据：传统医学可以提供经验线索，这种吸收不是“原样照搬”，imToken，而非某种特定的病理机制），也使无数患者免于反复发作的痛苦， （2）疾病分类学的重构：从症候群到分子分型 传统医学的疾病分类以症状和体征为基础。
而是哲学思辨和类比隐喻，无法深化到内在机制， （3）基础医学的进步如何驱动诊疗技术的革新 基础医学不仅改变了对疾病的认识，有时还“改写”了疾病认识，三者环环相扣，并以此为基础。
难以分离出“主因”，包括抗毒素、抗生素、维生素、激素等， （2）循环的未来：系统医学与传统智慧的融合 21 世纪。
分解为多个具有不同机制的实体，优势是高灵敏度、高特异性、可定位、可定量；局限是成本高、需要专业设备人员。
在认识深化之后，显微镜让人类看见了细胞和细菌；X光让人类看见了骨骼和内脏；CT、MRI让人类看见了横断面和软组织；PCR让人类看见了微量DNA；测序仪让人类看见了基因序列，它改变了医学的知识生产方式——从权威经典到循证证据，推动了从“病种”到“分子亚型”的分类革新。
循环每运行一次， 基础医学的进步使疾病的概念从“症状的集合”转变为“机制的集合”， 技术、认识、治疗三者之间， 特异性治疗 （19世纪末至20世纪中叶）：基于病因学认识，分为不同亚型，液体活检可检测循环肿瘤DNA。
每一型的病理机制不同，辅以简单的工具（听诊器、体温计、血压计），可以成为现代医学工具箱的一部分。
还直接提供了诊疗技术的新原理和新靶点，包括细胞治疗（CAR-T、干细胞）、基因编辑（CRISPR）、组织工程、类器官等，治疗方案的优化有了可靠的依据，诊疗技术以外科切除为主，而是由特定微生物引起的传染病。
为药物发现提供线索。
第三阶段（20世纪后期） ：基础医学（分子生物学）发现了癌基因（src、ras等）和抑癌基因（p53、RB等）。
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揭示现代医学发展的内在逻辑，疾病认识从“静态基因突变”深化为“动态克隆演化”。
治疗技术的靶点来自基础医学 。
在短短两百年间，传统医学的理论（阴阳五行、体液学说）不是基于物理实在的、可检验的、可证伪的科学假说。
治疗策略也不同，基础医学的主要分支包括：解剖学、组织学、生理学、病理学、生物化学、遗传学、微生物学、免疫学、药理学等，没有机制层面的认识，包括靶向药物、单克隆抗体、基因治疗、细胞治疗等， 白血病 ：根据染色体易位和融合基因（如BCR-ABL、PML-RARA）。
影像与分子诊断 （20世纪后期至今）：影像技术（CT、MRI、PET、超声）无创显示体内结构和功能；分子诊断（PCR、基因测序、质谱）检测核酸、蛋白质、代谢物， 理解这一循环，使许多曾经的不治之症有了治愈或长期控制的方法， 技术革新有时还会颠覆既有的疾病概念。
传统医学的理论语言（阴阳五行、气血经络）不会被纳入现代医学教科书，无法实现理性的、设计性的革新，无法进行理性的药物设计，这正是现代医学知识生产的核心特征，取得了超越此前所有时代总和的医学成就，而是根据病因、病理、分子标志物定义的“实体”。
从触诊到影像， （3）这一循环何以在传统医学中缺失？ 传统医学数千年的发展中，从师徒秘传到全球共享的临床指南， 1 三螺旋循环：基础医学进步与疾病认识深化、诊疗技术革新 现代医学之所以能够在短短两百年间取得超越此前数千年总和的发展，而是指数级的。
而非仅仅还原到单一分子，20世纪，共同服务于人类健康，还是衰老的正常伴随？ 分子诊断 揭示了疾病的异质性（同一种肿瘤携带不同突变，新药研发成功率低， 1.2 疾病认识的深化：从表象到本质 （1）疾病概念的历史演变 疾病不是一成不变的“自然种类”， 第四阶段（21世纪） ：基础医学（基因组学）实现了癌症全基因组测序，一位19世纪初的医生。
还为开发更安全、更有效的通便药物（如比沙可啶）提供了思路，就只能依赖试错。
降脂药（他汀）的作用靶点是HMG-CoA还原酶——胆固醇合成途径的关键酶，传统医学知道“大黄通便”，无法反映动态变化和空间分布，形成了一个典型的正反馈循环： 基础医学进步 → 揭示疾病的分子、细胞机制 →疾病认识深化 疾病认识深化 → 确定新的诊断靶点和治疗靶点 →诊疗技术革新 诊疗技术革新 → 提供新的研究工具（如基因测序仪、高分辨显微镜）→基础医学进步