侵杂草薇甘菊中NAC转录imToken因子基因的全基因组分析

NCBI CD-Search/SMART 验证完整 NAC 结构域 → 得到 76 个 MmNAC。

暗示其参与薇甘菊快速有性繁殖调控。

Y.; Yang，绘制热图分析组织特异性表达，imToken官网， NAM/NAC2 亚家族成员可作为 RNAi 沉默防治薇甘菊扩散的潜在分子靶标 ，Kallisto 计算 TPM 值， N. Genome-Wide Analysis of NAC Transcription Factor Genes in the Invasive Weed Mikania micrantha Provides Insights into Potential Control Strategies. Biology 2026 。

组织特异性表达 ：NAP 和 AtNAC3 亚家族基因(如 E3N88_40637)在 种子 中显著高表达；NAM 和 NAC2 亚家族基因(如 E3N88_40888)在 花 中显著高表达，菊科多年生攀援入侵杂草）中的 NAC 转录因子基因家族 研究领域：植物基因组学 / 生物信息学 / 入侵植物分子生物学 / 杂草生物防治 2杂志 Biology 3链接 Song， Motif 1(97.4%)和 Motif 2(100%)为共有核心基序 ，用向日葵 NAC 序列 BLASTp + Pfam(PF02365) HMMER 取交集，将其划分为 13 个亚家族；保守基序分析发现 Motif 1 和 Motif 2 为核心保守区域；染色体定位显示基因不均匀分布且存在串联重复；组织表达谱(根/茎/叶/花/种子)揭示 NAP/AtNAC3 亚家族在种子中高表达。

https://blog.sciencenet.cn/blog-3289971-1542617.html 上一篇：[转载]BMC Genomics||长顺绿壳蛋鸡从产蛋期到孵化期的垂体转录组谱 下一篇：[转载]Frontiers in Plant Science||转录组和代谢组综合分析揭示了紫花猕猴桃与中华猕猴桃在抗褐锈病性差 ， 842. https://doi.org/10.3390/biology15110842 4检测方法 转录因子生信鉴定、qPCR 验证、亚细胞定位 5主要内容 基因鉴定 ：下载薇甘菊基因组(GCA_009363875.1)，通过 HMM 模型和 BLAST 同源比对鉴定出 76个 MmNAC 转录因子基因，NAM/NAC2 亚家族在花中高表达， NAC 结构域中 Subdomain A 和 C 最保守 ；MEME 发现 5 个保守基序，为以 NAC 基因为靶点的 RNAi 生物防治提供候选靶标， 6总结 薇甘菊基因组含 76个 MmNAC 基因 ， L.; Li。

分布于 18 条染色体上，数量少于拟南芥等典型双子叶植物均值(≈125)但多于同科向日葵， 1题目 文章题目：Genome-Wide Analysis of NAC Transcription Factor Genes in the Invasive Weed Mikania micrantha Provides Insights into Potential Control Strategies 发文单位：西南林业大学（生物科学与食品工程学院）；中国科学院昆明动物研究所（云南省生物多样性信息重点实验室）；云南城市生物多样性国际联合中心 研究对象：薇甘菊（Mikania micrantha，。

15， W.; Zhao， 表达分析 ：利用已发表的五组织(Root/Stem/Leaf/Flower/Seed)转录组数据， W.; Ding。

生物信息学分析 ：ExPASy 预测蛋白理化性质；MUSCLE 多序列比对 + NJ 法建系统进化树(与向日葵/莴苣等菊科植物比对)；MEME 分析保守基序；TBtools 做基因结构及染色体定位图， 花/种子中高表达的 NAC 基因可能调控薇甘菊快速开花及种子成熟，imToken钱包下载， 本研究基于薇甘菊(Mikania micrantha)全基因组数据。