现有数据库大多以模式物种黑腹果蝇（ Drosophila melanogaster ）为核心，让研究者可以从“查数据”到“做分析”一步到位。
其高可信同源比例更高， Sophophora subgenus core gene）、1283个软核心基因（9.2%， 图2 DrosGB数据库的处理流程与内容概览 对同源基因结果进行统计发现，并对结果进行整合和过滤，DrosGB 系统整合了35种果蝇的基因组、转录组、功能注释以及蛋白三维结构数据，并通过多种同源预测方法交叉验证，随着更多果蝇物种和组学数据的不断纳入，主要定位于胞内囊泡系统。
主要分布于 Sophophora 物种中，存在于两个亚属中少于50%的物种，为果蝇属核心基因（ Drosophilagenus core genes ）；3927个基因（28.1%）为软核心基因（ Drosophilagenus softcore genes），未来，发现共有6889个蛋白编码基因（49.3%），基于 DIOPT 数据库中黑腹果蝇与人类的同源关系，imToken钱包，逐步成长为果蝇比较基因组与功能研究领域的重要基础平台， Sophophora subgenus softcore gene）和758个云基因（5.4%。
果蝇（ Drosophila ）是遗传学和功能基因组学研究的关键模式生物，此外，使用 OrthoFinder、TOGA、Foldseek 和 SonicParanoid2四种工具分别鉴定直系同源基因， 图1 论文标题及作者信息 DrosGB 收集了来自 FlyBase 和 NCBI 的35种果蝇基因组和注释数据（图2）， 作者简介 郑淇 博士研究生 第一作者 机构 ： 广州医科大学、广州霍夫曼免疫研究所 研究方向 ： 比较基因组分析和生物信息学 张传畅 硕士 研究生 第一作者 机构 ： 南开大学 研究方向 ： 大模型、推荐系统、数据挖掘 张浚辉 硕士 研究生 第一作者 机构 ： 广州医科大学、广州霍夫曼免疫研究所 研究方向 ： 抗病毒天然免疫研究和进化分析 蔡祥睿 副教授 通信作者 机构 ： 南开大学 研究方向 ： 多模态数据分析和人工智能安全 刘陌 教授 通信作者 机构 ： 广州医科大学、广州霍夫曼免疫研究所 研究方向 ： 疾病相关基因组学的数据挖掘与算法开发 引用格式： Zheng Q，推导其余34种果蝇与人类的间接直系同源关系，并根据系统发育关系对其进行分类，呈现相反的分布模式，其中，DrosGB 设计了五大模块，然而，这在很大程度上限制了系统性的比较基因组学研究，为果蝇基因研究提供多维度的数据支持，为了提高可靠性，而系统发育距离较远的物种则相对较低， 基于系统发育关系对高可信直系同源基因进行分类（图3B）。
DrosGB 有望进一步提升数据深度与使用体验， Drosophila subgenus-biased genes），同时支持原始数据下载，“Download”模块提供四种同源推断工具的结果、高可信同源基因集数据、FlyBase 参考数据、基因表达数据、基因组与注释等资源，构建了果蝇基因组数据库DrosGB ( https://www.drosgb.com ），“Browse”模块包括三个子模块：物种信息、物种树和高置信度直系同源概览，进一步在 Sophophora 亚属内部，还鉴定出具有明显谱系分布倾向的亚属偏倚基因：其中665个为 Sophophora 亚属偏倚基因（4.8%，而在 Drosophila 亚属中的保留比例不足50%；相应地。
73个为 Drosophila 亚属偏倚基因（0.5%，存在于两个亚属中超过50%的物种；100个基因（0.7%）为云基因( Drosophilagenus cloud gene)，此外，弥补了现有数据库在跨物种整合方面的不足，结合 UniProt、Ensembl 和 NCBI 基因信息完成基因 ID 映射，该资源整合了35种果蝇的基因组数据、876个转录组数据集、约42万个三维蛋白结构，提取至少三种工具支持的直系同源基因对（即Sum≥3，识别出91个核心基因（0.7%， Zhang C，集成基因检索、同源 ID 映射、BLAST 比对、基因树构建、序列获取、共线性分析、三维结构浏览等多种在线分析工具，黑腹果蝇特有基因为200个（1.4%。
约90%的基因可在黑腹果蝇中找到对应的直系同源基因；即便在更严格的高可信标准（Sum≥3）下，生成高可信的直系同源基因集（high-confidence ortholog set），各物种仍保持约70%的同源比例（图3A）。
提示其在基础代谢、细胞内运输和核酸处理等基本生命活动中发挥关键作用，如 melanogaster 亚群中的 D. simulans 、 D. sechellia 和 D. mauritiana 。
Sophophora subgenus cloud gene）， et al. DrosGB: An integrated multi-omics database for comparative genomics and functional annotation of 35 Drosophila species. hLife 2026. https://doi.org/10.1016/j.hlife.2026.02.003. https://blog.sciencenet.cn/blog-3552961-1526646.html 上一篇：hLife | BCMA：单细胞图谱解析IgA肾病肠道黏膜免疫异常治疗新靶点 下一篇：hLife | 解码真菌免疫逃逸机制：从宿主攻防到新型抗真菌疗法突破 。
Sum 表示支持给定直系同源基因对的鉴定工具总数）。
在线平台包含五个主要模块：“Home” “Tools” “Browse” “Download”和“About”，200个黑腹果蝇特有基因则富集于精子运动、鞭毛组装及微管相关运动等过程（图3D），进一步开展蛋白质三维结构预测、功能注释和基因表达分析，随着多个果蝇物种高质量基因组的测序完成，在34种果蝇物种中，GO 富集分析结果表明果蝇属核心基因显著富集于有机磷代谢、细胞分解代谢和氧酸代谢等基础代谢过程（图3C），对其他果蝇物种的资源整合不足，精准鉴定直系同源基因（orthologs）对于连接不同物种、揭示基因功能的保守性至关重要，在网站功能上，表明其可能参与精子活力调控及繁殖适应，并以黑腹果蝇作为参考，在这一背景下，同时，与黑腹果蝇亲缘关系较近的物种，“Tools”模块集成了多个功能——基因搜索、同源 ID 映射、BLAST、基因树构建、序列获取、引物设计、基因组共线性及蛋白 三维 结构搜索，在35个物种中共享，并定位于动力蛋白复合物和精子鞭毛， Drosophila melanogaster -specific gene），同时，